Regulamin organizacyjny Małopolskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Krakowie, obowiazujący od 6 sierpnia 2026 r., został nadany Zarządzeniem Nr 57 Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Krakowie z dnia 6 sierpnia 2026 r. w sprawie nadania Małopolskiemu Urzędowi Celno-Skarbowemu w Krakowie Regulaminu organizacyjnego.